Su mandato della Confederazione, Pronovo è responsabile dei programmi d'incentivazione delle energie rinnovabili in Svizzera: la rimunerazione unica (RU), il premio di mercato fluttuante (PMF), il contributo d'investimento (CI), il contributo alle spese d'esercizio (CSE) per impianti a biomassa, il sistema di rimunerazione per l'immissione di elettricità (SRI) e il finanziamento dei costi supplementari (FCS). Pronovo gestisce inoltre il sistema delle garanzie di origine per l'elettricità e per i combustibili e i carburanti rinnovabili.